COL14A1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | COL14A1, UND, Collagen, type XIV, alpha 1, collagen type XIV alpha 1, collagen type XIV alpha 1 chain |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 120324 MGI: 1341272 HomoloGene: 18741 GeneCards: COL14A1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein-macromolecule adaptor activity • extracellular matrix structural constituent • collagen binding • RNA binding • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength |
---|
Клітинна компонента | • GO:0005578 Позаклітинна матриця • колаген • endoplasmic reticulum lumen • екзосома • collagen type XIV trimer • міжклітинний простір • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • адгезія клітин • collagen fibril organization • extracellular matrix organization • cell-cell adhesion • growth plate cartilage chondrocyte morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 120.06 – 120.37 Mb | Хр. 15: 55.17 – 55.38 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL14A1 (англ. Collagen type XIV alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 796 амінокислот, а молекулярна маса — 193 515[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKIFQRKMRY | | WLLPPFLAIV | | YFCTIVQGQV | | APPTRLRYNV | | ISHDSIQISW |
KAPRGKFGGY | | KLLVTPTSGG | | KTNQLNLQNT | | ATKAIIQGLM | | PDQNYTVQII |
AYNKDKESKP | | AQGQFRIKDL | | EKRKDPKPRV | | KVVDRGNGSR | | PSSPEEVKFV |
CQTPAIADIV | | ILVDGSWSIG | | RFNFRLVRHF | | LENLVTAFDV | | GSEKTRIGLA |
QYSGDPRIEW | | HLNAFSTKDE | | VIEAVRNLPY | | KGGNTLTGLA | | LNYIFENSFK |
PEAGSRTGVS | | KIGILITDGK | | SQDDIIPPSR | | NLRESGVELF | | AIGVKNADVN |
ELQEIASEPD | | STHVYNVAEF | | DLMHTVVESL | | TRTLCSRVEE | | QDREIKASAH |
AITGPPTELI | | TSEVTARSFM | | VNWTHAPGNV | | EKYRVVYYPT | | RGGKPDEVVV |
DGTVSSTVLK | | NLMSLTEYQI | | AVFAIYAHTA | | SEGLRGTETT | | LALPMASDLL |
LYDVTENSMR | | VKWDAVPGAS | | GYLILYAPLT | | EGLAGDEKEM | | KIGETHTDIE |
LSGLLPNTEY | | TVTVYAMFGE | | EASDPVTGQE | | TTLALSPPRN | | LRISNVGSNS |
ARLTWDPTSR | | QINGYRIVYN | | NADGTEINEV | | EVDPITTFPL | | KGLTPLTEYT |
IAIFSIYDEG | | QSEPLTGVFT | | TEEVPAQQYL | | EIDEVTTDSF | | RVTWHPLSAD |
EGLHKLMWIP | | VYGGKTEEVV | | LKEEQDSHVI | | EGLEPGTEYE | | VSLLAVLDDG |
SESEVVTAVG | | TTLDSFWTEP | | ATTIVPTTSV | | TSVFQTGIRN | | LVVGDETTSS |
LRVKWDISDS | | DVQQFRVTYM | | TAQGDPEEEV | | IGTVMVPGSQ | | NNLLLKPLLP |
DTEYKVTVTP | | IYTDGEGVSV | | SAPGKTLPSS | | GPQNLRVSEE | | WYNRLRITWD |
PPSSPVKGYR | | IVYKPVSVPG | | PTLETFVGAD | | INTILITNLL | | SGMDYNVKIF |
ASQASGFSDA | | LTGMVKTLFL | | GVTNLQAKHV | | EMTSLCAHWQ | | VHRHATAYRV |
VIESLQDRQK | | QESTVGGGTT | | RHCFYGLQPD | | SEYKISVYTK | | LQEIEGPSVS |
IMEKTQSLPT | | RPPTFPPTIP | | PAKEVCKAAK | | ADLVFMVDGS | | WSIGDENFNK |
IISFLYSTVG | | ALNKIGTDGT | | QVAMVQFTDD | | PRTEFKLNAY | | KTKETLLDAI |
KHISYKGGNT | | KTGKAIKYVR | | DTLFTAESGT | | RRGIPKVIVV | | ITDGRSQDDV |
NKISREMQLD | | GYSIFAIGVA | | DADYSELVSI | | GSKPSARHVF | | FVDDFDAFKK |
IEDELITFVC | | ETASATCPVV | | HKDGIDLAGF | | KMMEMFGLVE | | KDFSSVEGVS |
MEPGTFNVFP | | CYQLHKDALV | | SQPTRYLHPE | | GLPSDYTISF | | LFRILPDTPQ |
EPFALWEILN | | KNSDPLVGVI | | LDNGGKTLTY | | FNYDQSGDFQ | | TVTFEGPEIR |
KIFYGSFHKL | | HIVVSETLVK | | VVIDCKQVGE | | KAMNASANIT | | SDGVEVLGKM |
VRSRGPGGNS | | APFQLQMFDI | | VCSTSWANTD | | KCCELPGLRD | | DESCPDLPHS |
CSCSETNEVA | | LGPAGPPGGP | | GLRGPKGQQG | | EPGPKGPDGP | | RGEIGLPGPQ |
GPPGPQGPSG | | LSIQGMPGMP | | GEKGEKGDTG | | LPGPQGIPGG | | VGSPGRDGSP |
GQRGLPGKDG | | SSGPPGPPGP | | IGIPGTPGVP | | GITGSMGPQG | | ALGPPGVPGA |
KGERGERGDL | | QSQAMVRSVA | | RQVCEQLIQS | | HMARYTAILN | | QIPSHSSSIR |
TVQGPPGEPG | | RPGSPGAPGE | | QGPPGTPGFP | | GNAGVPGTPG | | ERGLTGIKGE |
KGNPGVGTQG | | PRGPPGPAGP | | SGESRPGSPG | | PPGSPGPRGP | | PGHLGVPGPQ |
GPSGQPGYCD | | PSSCSAYGVR | | APHPDQPEFT | | PVQDELEAME | | LWGPGV |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bauer M., Dieterich W., Ehnis T., Schuppan D. (1997). Complete primary structure of human collagen type XIV (undulin). Biochim. Biophys. Acta. 1354: 183—188. PMID 9427527 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00131-0
- Brown J.C., Golbik R., Mann K., Timpl R. (1994). Structure and stability of the triple-helical domains of human collagen XIV. Matrix Biol. 14: 287—295. PMID 7827751 DOI:10.1016/0945-053X(94)90194-5
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2191 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q05707 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |