COL21A1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | COL21A1, collagen, type XXI, alpha 1, COLA1L, dJ682J15.1, dJ708F5.1, FP633, collagen type XXI alpha 1, collagen type XXI alpha 1 chain |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610002 HomoloGene: 49949 GeneCards: COL21A1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • колаген • endoplasmic reticulum lumen • гіалоплазма • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • growth plate cartilage chondrocyte morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_030820 NM_001318751 NM_001318752 NM_001318753 NM_001318754 |
| | XM_002664080 XM_017358912 XM_017358915 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001305680 NP_001305681 NP_001305682 NP_001305683 NP_110447 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 56.06 – 56.39 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL21A1 (англ. Collagen type XXI alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 957 амінокислот, а молекулярна маса — 99 369[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAHYITFLCM | | VLVLLLQNSV | | LAEDGEVRSS | | CRTAPTDLVF | | ILDGSYSVGP |
ENFEIVKKWL | | VNITKNFDIG | | PKFIQVGVVQ | | YSDYPVLEIP | | LGSYDSGEHL |
TAAVESILYL | | GGNTKTGKAI | | QFALDYLFAK | | SSRFLTKIAV | | VLTDGKSQDD |
VKDAAQAARD | | SKITLFAIGV | | GSETEDAELR | | AIANKPSSTY | | VFYVEDYIAI |
SKIREVMKQK | | LCEESVCPTR | | IPVAARDERG | | FDILLGLDVN | | KKVKKRIQLS |
PKKIKGYEVT | | SKVDLSELTS | | NVFPEGLPPS | | YVFVSTQRFK | | VKKIWDLWRI |
LTIDGRPQIA | | VTLNGVDKIL | | LFTTTSVING | | SQVVTFANPQ | | VKTLFDEGWH |
QIRLLVTEQD | | VTLYIDDQQI | | ENKPLHPVLG | | ILINGQTQIG | | KYSGKEETVQ |
FDVQKLRIYC | | DPEQNNRETA | | CEIPGFNGEC | | LNGPSDVGST | | PAPCICPPGK |
PGLQGPKGDP | | GLPGNPGYPG | | QPGQDGKPGY | | QGIAGTPGVP | | GSPGIQGARG |
LPGYKGEPGR | | DGDKGDRGLP | | GFPGLHGMPG | | SKGEMGAKGD | | KGSPGFYGKK |
GAKGEKGNAG | | FPGLPGPAGE | | PGRHGKDGLM | | GSPGFKGEAG | | SPGAPGQDGT |
RGEPGIPGFP | | GNRGLMGQKG | | EIGPPGQQGK | | KGAPGMPGLM | | GSNGSPGQPG |
TPGSKGSKGE | | PGIQGMPGAS | | GLKGEPGATG | | SPGEPGYMGL | | PGIQGKKGDK |
GNQGEKGIQG | | QKGENGRQGI | | PGQQGIQGHH | | GAKGERGEKG | | EPGVRGAIGS |
KGESGVDGLM | | GPAGPKGQPG | | DPGPQGPPGL | | DGKPGREFSE | | QFIRQVCTDV |
IRAQLPVLLQ | | SGRIRNCDHC | | LSQHGSPGIP | | GPPGPIGPEG | | PRGLPGLPGR |
DGVPGLVGVP | | GRPGVRGLKG | | LPGRNGEKGS | | QGFGYPGEQG | | PPGPPGPEGP |
PGISKEGPPG | | DPGLPGKDGD | | HGKPGIQGQP | | GPPGICDPSL | | CFSVIARRDP |
FRKGPNY |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Fitzgerald J., Bateman J.F. (2001). A new FACIT of the collagen family: COL21A1. FEBS Lett. 505: 275—280. PMID 11566190 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02754-5
- Chou M.-Y., Li H.-C. (2002). Genomic organization and characterization of the human type XXI collagen (COL21A1) gene. Genomics. 79: 395—401. PMID 11863369 DOI:10.1006/geno.2002.6712
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17025 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96P44 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |