COL15A1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | COL15A1, collagen type XV alpha 1 chain |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 120325 MGI: 88449 HomoloGene: 1396 GeneCards: COL15A1 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
ocriplasmin[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • extracellular matrix structural constituent • structural molecule activity • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • базальна мембрана • колаген • endoplasmic reticulum lumen • екзосома • collagen type XV trimer • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • collagen catabolic process • multicellular organism development • диференціація клітин • Ангіогенез • GO:0072468 сигнальна трансдукція • адгезія клітин • extracellular matrix organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 98.94 – 99.07 Mb | Хр. 4: 47.21 – 47.31 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL15A1 (англ. Collagen type XV alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 388 амінокислот, а молекулярна маса — 141 720[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPRRNNGQC | | WCLLMLLSVS | | TPLPAVTQTR | | GATETASQGH | | LDLTQLIGVP |
LPSSVSFVTG | | YGGFPAYSFG | | PGANVGRPAR | | TLIPSTFFRD | | FAISVVVKPS |
STRGGVLFAI | | TDAFQKVIYL | | GLRLSGVEDG | | HQRIILYYTE | | PGSHVSQEAA |
AFSVPVMTHR | | WNRFAMIVQG | | EEVTLLVNCE | | EHSRIPFQRS | | SQALAFESSA |
GIFMGNAGAT | | GLERFTGSLQ | | QLTVHPDPRT | | PEELCDPEES | | SASGETSGLQ |
EADGVAEILE | | AVTYTQASPK | | EAKVEPINTP | | PTPSSPFEDM | | ELSGEPVPEG |
TLETTNMSII | | QHSSPKQGSG | | EILNDTLEGV | | HSVDGDPITD | | SGSGAGAFLD |
IAEEKNLAAT | | AAGLAEVPIS | | TAGEAEASSV | | PTGGPTLSMS | | TENPEEGVTP |
GPDNEERLAA | | TAAGEAEALA | | SMPGEVEASG | | VAPGELDLSM | | SAQSLGEEAT |
VGPSSEDSLT | | TAAAATEVSL | | STFEDEEASG | | VPTDGLAPLT | | ATMAPERAVT |
SGPGDEEDLA | | AATTEEPLIT | | AGGEESGSPP | | PDGPPLPLPT | | VAPERWITPA |
QREHVGMKGQ | | AGPKGEKGDA | | GEELPGPPEP | | SGPVGPTAGA | | EAEGSGLGWG |
SDVGSGSGDL | | VGSEQLLRGP | | PGPPGPPGLP | | GIPGKPGTDV | | FMGPPGSPGE |
DGPAGEPGPP | | GPEGQPGVDG | | ATGLPGMKGE | | KGARGPNGSV | | GEKGDPGNRG |
LPGPPGKKGQ | | AGPPGVMGPP | | GPPGPPGPPG | | PGCTMGLGFE | | DTEGSGSTQL |
LNEPKLSRPT | | AAIGLKGEKG | | DRGPKGERGM | | DGASIVGPPG | | PRGPPGHIKV |
LSNSLINITH | | GFMNFSDIPE | | LVGPPGPDGL | | PGLPGFPGPR | | GPKGDTGLPG |
FPGLKGEQGE | | KGEPGAILTE | | DIPLERLMGK | | KGEPGMHGAP | | GPMGPKGPPG |
HKGEFGLPGR | | PGRPGLNGLK | | GTKGDPGVIM | | QGPPGLPGPP | | GPPGPPGAVI |
NIKGAIFPIP | | VRPHCKMPVD | | TAHPGSPELI | | TFHGVKGEKG | | SWGLPGSKGE |
KGDQGAQGPP | | GPPLDLAYLR | | HFLNNLKGEN | | GDKGFKGEKG | | EKGDINGSFL |
MSGPPGLPGN | | PGPAGQKGET | | VVGPQGPPGA | | PGLPGPPGFG | | RPGDPGPPGP |
PGPPGPPAIL | | GAAVALPGPP | | GPPGQPGLPG | | SRNLVTAFSN | | MDDMLQKAHL |
VIEGTFIYLR | | DSTEFFIRVR | | DGWKKLQLGE | | LIPIPADSPP | | PPALSSNPHQ |
LLPPPNPISS | | ANYEKPALHL | | AALNMPFSGD | | IRADFQCFKQ | | ARAAGLLSTY |
RAFLSSHLQD | | LSTIVRKAER | | YSLPIVNLKG | | QVLFNNWDSI | | FSGHGGQFNM |
HIPIYSFDGR | | DIMTDPSWPQ | | KVIWHGSSPH | | GVRLVDNYCE | | AWRTADTAVT |
GLASPLSTGK | | ILDQKAYSCA | | NRLIVLCIEN | | SFMTDARK |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, ангіогенез, диференціація клітин. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Haegg P.M., Muona A., Lietard J., Kivirikko S., Pihlajaniemi T. (1998). Complete exon-intron organization of the human gene for the alpha1 chain of type XV collagen (COL15A1) and comparison with the homologous COL18A1 gene. J. Biol. Chem. 273: 17824—17831. PMID 9651385 DOI:10.1074/jbc.273.28.17824
- Myers J.C., Kivirikko S., Gordon M.K., Dion A.S., Pihlajaniemi T. (1992). Identification of a previously unknown human collagen chain, alpha 1(XV), characterized by extensive interruptions in the triple-helical region. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 10144—10148. PMID 1279671 DOI:10.1073/pnas.89.21.10144
- John H., Radtke K., Staendker L., Forssmann W.G. (2005). Identification and characterization of novel endogenous proteolytic forms of the human angiogenesis inhibitors restin and endostatin. Biochim. Biophys. Acta. 1747: 161—170. PMID 15698950 DOI:10.1016/j.bbapap.2004.10.013
- Li D., Clark C.C., Myers J.C. (2000). Basement membrane zone type XV collagen is a disulfide-bonded chondroitin sulfate proteoglycan in human tissues and cultured cells. J. Biol. Chem. 275: 22339—22347. PMID 10791950 DOI:10.1074/jbc.M000519200
- Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
- Muragaki Y., Abe N., Ninomiya Y., Olsen B.R., Ooshima A. (1994). The human alpha 1(XV) collagen chain contains a large amino-terminal non-triple helical domain with a tandem repeat structure and homology to alpha 1(XVIII) collagen. J. Biol. Chem. 269: 4042—4046. PMID 8307960
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL15A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2192 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P39059 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |